Rocc: gestão e análise de dados de ocorrências de espécies

By Sara Mortara & Andrea Sánchez-Tapia in biodiversity informatics español ¡liibre! open science português R talk

November 12, 2021

Abstract

Apresentamos em Latin-R 2021 o pacote Rocc para obtenção e checagem de dados de biodiversidade

Date

November 12, 2021

Time

12:00 AM

Event

O pacote Rocc se propõe auxiliar a geração de rotinas automatizadas de obtenção e checagem de dados de biodiversidade usando ferramentas como speciesLink (https://specieslink.net/), Flora do Brasil (http://floradobrasil.jbrj.gov.br/refl...) e GADM (https://gadm.org/data.html). O objetivo do pacote é automatizar tarefas repetidas e facilitar a tomada de decisão por parte de especialistas e não exclui a necessidade de uma avaliação contextual dos dados. O pacote permite estabelecer um fluxo de trabalho desde a obtenção do dado até a checagem de nomenclatura taxonômica e geográfica e também permite que cada uma das funções seja utilizada de forma independente.

O pacote Rocc possui três grandes eixos: obtenção de dados de ocorrência, checagem taxonômica e obtenção de dados geográficos. A partir dos três eixos do pacote de obtenção de dados de biodiversidade, checagem taxonômica e obtenção de dados geográficos, é possível criar fluxos de trabalho reprodutíveis totalmente baseados em dados abertos para obtenção e limpeza de dados de biodiversidade. Na página do pacote existem artigos para guiar o desenvolvimento de fluxos de trabalho (https://liibre.github.io/Rocc/articles/). Com isso, espera-se facilitar o acesso a diferentes bases e permitir autonomia às pessoas usuárias de criarem seus próprios fluxos de trabalho adaptados a sua necessidade.

Pre-recorded talk:

Live session:

Posted on:
November 12, 2021
Length:
1 minute read, 198 words
Categories:
biodiversity informatics español ¡liibre! open science português R talk
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